Pada 22 Maret 2025, STT Amanat Agung dan Sekolah Kristen IPEKA bersepakat memulai kerja sama. Nota Kesepahaman (Memorandum of Understanding) ditandatangani di kampus STTAA oleh Ketua STTAA, Pdt. Casthelia Kartika, D.Th., dan Direktur Utama Sekolah Kristen IPEKA, Pdt. Handojo, S.T., M.Th. Penandatanganan disaksikan oleh Ketua Yayasan Amanat Agung Indonesia, Bpk. Ohendry Husin, dan Ketua Yayasan Iman, Pengharapan, dan Kasih (IPEKA), Bpk. Erwin Tenggono, serta beberapa dosen dan anggota-anggota yayasan-yayasan lain yang bernaung di bawah Sinode Gereja Kristus Yesus. Kiranya kerja sama ini semakin mengembangkan mutu dan pelayanan masing-masing institusi.